44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2867 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  99.29 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  58.87 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  31.72 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  31.72 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  34.43 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  34.29 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  33.9 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  37.41 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.51 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  31.08 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  35.48 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  30.5 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.5 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  29.51 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  33.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  33.06 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.22 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.22 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2456  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  34.67 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  26.9 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.06 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  31.39 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  29.75 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  31.9 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  30 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.87 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.64 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30.28 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  33.57 
 
 		 140 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>