36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4274 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  84.17 
 
 		 139 aa  244  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  69.78 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  69.78 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  65.47 
 
 		 136 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  64.03 
 
 		 136 aa  186  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  38.33 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.79 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  34.29 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  32.52 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  38.24 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  36.81 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.45 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  28.35 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  28.69 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  35.14 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.39 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  34.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  26.81 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  28.26 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  24.82 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.84 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  27.68 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  28.93 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  25.37 
 
 		 135 aa  42  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  25.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  26.02 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>