69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4252 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  52.67 
 
 		 139 aa  140  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  48.48 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  55 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  50.38 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  53.68 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  45.04 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  44.17 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  36.73 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  39.86 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  39.13 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  37.12 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  44.03 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25150  hypothetical protein  69.77 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  34.78 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  34.71 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  35.2 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  32.23 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  32.23 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  33.88 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  37.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  32.52 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  33.88 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  34.07 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  38.79 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  35.59 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  30 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  35.29 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  28.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  35.43 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  34.33 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.93 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.93 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  29.5 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  33.88 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  32.28 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  33.61 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  33.61 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.68 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  34.21 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  32.28 
 
 		 174 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  34.45 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  34.45 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  34.45 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  32.28 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  33.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  34.06 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  29.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  28.67 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  33.65 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  30.66 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  33.9 
 
 		 161 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  29.82 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.33 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>