45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00608 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  54.74 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  54.01 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  42.96 
 
 		 154 aa  116  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  42.03 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  41.61 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  35.11 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  36.03 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  36.03 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  36.76 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.11 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  30.6 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  30.94 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  31.11 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  34.06 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.14 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  38 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  29.71 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  30.71 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  27.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  27.46 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  31.93 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  28.15 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  28.33 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  24.37 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  24.37 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  28.08 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  29.08 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  26.02 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.21 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>