36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2648 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  349  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  99.44 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  90.56 
 
 		 180 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  56.74 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  53.07 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  48.59 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  51.69 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  37.84 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  35.14 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  38 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  33.71 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  33.15 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  38.26 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  38.26 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  33.9 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  35.81 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  33.56 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  34.87 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  31.15 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  39.78 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  35.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  35.21 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  33.05 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  35.4 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  33.12 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  35.26 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  34.19 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  27.91 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>