44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1636 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  39.01 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  44.23 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  40.11 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  40.12 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  41.28 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  37.16 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  39.11 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  39.08 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  43.79 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  39.53 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  39.53 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  39.11 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  32.43 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  37.93 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  37.57 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  46.9 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  40.11 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  41.81 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  44.14 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  39.78 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  39.78 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  34.33 
 
 		 143 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  34.46 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  34.73 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  34.13 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  31.75 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  31.15 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3277  hypothetical protein  30.56 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  43.1 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  36.21 
 
 		 144 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  42.37 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  43.16 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>