38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1266 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  83.77 
 
 		 191 aa  328  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  62.83 
 
 		 191 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  57.46 
 
 		 189 aa  221  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  57.46 
 
 		 190 aa  214  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  52.94 
 
 		 171 aa  204  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  53.72 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  52.66 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  52.2 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  50.26 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  46.41 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  46.41 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  44.15 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  41.27 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  51.16 
 
 		 143 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  35.98 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  33.86 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  39.53 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  39.55 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  39.69 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  39.69 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  38.31 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  38.26 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  33.78 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  39.06 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  33.87 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  35.97 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  33.83 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  38.24 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  31.61 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  48.44 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  25.42 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  52.27 
 
 		 154 aa  41.2  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>