38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4152 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  65.45 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  62.83 
 
 		 191 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  62.83 
 
 		 191 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  57.06 
 
 		 171 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  59.12 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  57.46 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  59.46 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  49.46 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  57.3 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  52.2 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  55.98 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  48.62 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  49.17 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  46.37 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  43.41 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  39.06 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  37.57 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  36.09 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  37.84 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  41.91 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  35.82 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  35.82 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  34.97 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  34.48 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  36.57 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  33.12 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  32.98 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  31.36 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  27.43 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  24.73 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  39.44 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>