36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4423 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  78.57 
 
 		 196 aa  275  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  58.67 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  39.47 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  41.15 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  37.1 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  38.83 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  38.1 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  38.1 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  35.64 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  36.46 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  35.09 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  39.06 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  36.98 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  35.6 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  35.6 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  35.91 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  33.16 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  37.42 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  33.86 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  39.85 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  39.57 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  34.64 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  37.14 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  37.04 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  34.15 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  37.88 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  31.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  32.62 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  30.52 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  30.92 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  26.59 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  55.56 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>