37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  44.44 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  37.97 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  36.99 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  35.98 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  35.11 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  37.42 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  33.86 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  34.39 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  50.42 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  33.87 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  33.87 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  32.95 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  34.04 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  32.11 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  36.51 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  40.83 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  32.98 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  31.75 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  35.29 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  32.85 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  36.13 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  39.66 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  39.66 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  34.19 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  36.54 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2994  hypothetical protein  82.76 
 
 		 71 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  30.72 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  29.33 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>