32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8411 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  40.14 
 
 		 190 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  36.11 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  35.92 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  36.49 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  33.82 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  35.97 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  35.97 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  37.67 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  34.53 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  34.53 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  32.87 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  32.14 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  32.89 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  31.88 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  32.84 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  35.56 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  29.85 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  29.86 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  27.95 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  31.88 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  32.09 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  30.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  29.32 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  27.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  28.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>