37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0233 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  97.37 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  80 
 
 		 190 aa  317  9e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  57.07 
 
 		 189 aa  218  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  58.01 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  59.46 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  53.97 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  52.66 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  52.66 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  56.97 
 
 		 171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  55.43 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  50.54 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  47.22 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  49.46 
 
 		 191 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  41.3 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  53.15 
 
 		 143 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  36.51 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  45.52 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  39.39 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  37.67 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  37.4 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  33.86 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  35.11 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  37.93 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  31.4 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  33.82 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  33.82 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  33.11 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  36.49 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  45.12 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  26.63 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>