40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4762 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  90.58 
 
 		 191 aa  357  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  50.54 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  48.91 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  49.46 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  48.62 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  48.54 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  45.16 
 
 		 189 aa  160  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  47.59 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  44.68 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  44.15 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  44.15 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  39.56 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  38.33 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  38.83 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  44.96 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  39.57 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  42.64 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  34.04 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  38.58 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  41.54 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  37.8 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  31.49 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  35.81 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  38.04 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  39.11 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  38.35 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  33.86 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  28.96 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  32.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  25.7 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  42.65 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  44 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  52.27 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  45.1 
 
 		 142 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>