25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13781 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  350  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  40.83 
 
 
194 aa  87.8  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  38.74 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  44.33 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  38.94 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  45.12 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  37.17 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  45.45 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  45.12 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  36.45 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  45.12 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  43.59 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  38.53 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  38.53 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  37.8 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  35.96 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  39.02 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  40.79 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  40.79 
 
 
196 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  53.45 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  42.62 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  46.55 
 
 
179 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  35.35 
 
 
192 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  36.11 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>