39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2688 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  55.31 
 
 
180 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  51.4 
 
 
179 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  53.07 
 
 
180 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  53.07 
 
 
180 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  49.44 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  46.89 
 
 
179 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  37.34 
 
 
171 aa  99  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  36.16 
 
 
189 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  36.42 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  40.41 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  39.87 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  35.52 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  37.67 
 
 
190 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  32.96 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  36.24 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  38.35 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  34.97 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  38.31 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  38.31 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  44.54 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  30.51 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  38.24 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  38.57 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  31.69 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  38.71 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  38.97 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  32.85 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  32.41 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  30.08 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  34.67 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  31.93 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  42.86 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  31.58 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  35.4 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>