36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0337 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  78.57 
 
 
196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  57.14 
 
 
196 aa  198  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  38.46 
 
 
190 aa  128  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  37.23 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  35.45 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  35.98 
 
 
191 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  35.98 
 
 
191 aa  111  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  36.51 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  36.51 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  104  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  35.98 
 
 
191 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  35.29 
 
 
188 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  37.57 
 
 
191 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  35.56 
 
 
189 aa  101  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  34.12 
 
 
171 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  33.87 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  39.26 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  36.91 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  38.57 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  40.46 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  32.35 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  38.52 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  39.26 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  34.75 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  35.21 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  30.15 
 
 
144 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  28.65 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>