30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1588 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  29.02 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  29.24 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  32.81 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  34.15 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  35.33 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  33.54 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  28.42 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  32.56 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  28.96 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  27.95 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  26.47 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  32.69 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  32.41 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  30.21 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  30.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  30.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  25.26 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  29.17 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  28.27 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  29.56 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  31.54 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  27.32 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  25.83 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  26.63 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>