38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0888 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  351  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  56.74 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  57.3 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  56.18 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  51.4 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  48.59 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  48.07 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  42.64 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  42.64 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  35.34 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  33.88 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  35.21 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  39.06 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  39.06 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  37.12 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  32.2 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  33.52 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  33.8 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  29.38 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  39.2 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  33.59 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  32.31 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  37.14 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  36.13 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  37.04 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  34.07 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  25.81 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.95 
 
 		 146 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  30.5 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  30.07 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>