25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0103 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  80.61 
 
 		 105 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  52.63 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  52.14 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  48.92 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  45.32 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  40 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  34.53 
 
 		 140 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  35.21 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  34.53 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  42.96 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  40 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  34.31 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  32.89 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  32.85 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  33.93 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  34.02 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  37.63 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  30.5 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  30.7 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>