31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3867 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 142 aa  294  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  44.85 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  45.59 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  40.43 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  43.8 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  41.54 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  36.5 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  36.03 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  33.81 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.58 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  40.28 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.27 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  38.64 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  26.47 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  26.9 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  26.76 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  27.61 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  25.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  24.11 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  24.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  46 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  28.68 
 
 		 145 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>