29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0993 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  287  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  99.29 
 
 
140 aa  285  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  54.74 
 
 
140 aa  167  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  53.33 
 
 
144 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  43.7 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  46.38 
 
 
153 aa  123  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  34.53 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  30.08 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  40.5 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  29.93 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  30.66 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  29.89 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.85 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  27.07 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.32 
 
 
140 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  25.4 
 
 
145 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  30.88 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  25.74 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  28.81 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  42 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  28.81 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  26.24 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>