42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2307 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  46.1 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  41.01 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  40.43 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  35.56 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  35.21 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  36.76 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  28.99 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  30.66 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.21 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  27.86 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  29.33 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.76 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  35.44 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  26.76 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  26.62 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  24.06 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  28.99 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  33.64 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  23.36 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  28.57 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  31.29 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  31.29 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  24.32 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  22.6 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  25.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  24.31 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  29.85 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  24.14 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.26 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>