14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2018 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  43.65 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  41.79 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  41.48 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  39.05 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  29.23 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  27.59 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  29.09 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  25.44 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  27.35 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  27.68 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>