13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4904 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  41.79 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  42.96 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  42.22 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  36.84 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  38.1 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  31.53 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  32.48 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  27.74 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  25.74 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  24.46 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.03 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>