17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6726 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  286  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  95.62 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  42.22 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  42.96 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  38.1 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.35 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  28.67 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  42  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  28.93 
 
 		 147 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.38 
 
 		 141 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  26.4 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  54.29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  29.03 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>