51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1157 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  40.74 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  32.14 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  29.71 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  29.71 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  30.66 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  30.28 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  29.55 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  28.78 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  30.88 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  30.56 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  23.7 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  23.7 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  29.23 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  28.48 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  28.21 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  29.85 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  29.71 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  30.37 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  33.06 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  27.21 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.57 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.57 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  27.74 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  26.43 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  31.43 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  28.57 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  28.99 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  24.8 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  26 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  24.59 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  28.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  23.36 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  25.9 
 
 		 154 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  30.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  29.73 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  23.36 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>