36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2742 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  50.37 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  43.7 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  43.7 
 
 
140 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  42.96 
 
 
140 aa  116  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  41.04 
 
 
153 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  42.34 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  42.96 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  31.13 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  35.51 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  32.59 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  33.82 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  33.09 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  28.99 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.85 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  39.29 
 
 
119 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  29.63 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  31.19 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  44.29 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  31.11 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  47.06 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  24.64 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  29.25 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  27.78 
 
 
136 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  29.09 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  25.9 
 
 
146 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  39.66 
 
 
189 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  27.52 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  27.52 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  24.44 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  51.35 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>