49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3133 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  56.92 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  53.33 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  54.26 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  54.26 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  47.29 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  50 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  44.19 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  41.41 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  37.68 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  34.33 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  50.79 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  37.59 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  36.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  30.83 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  35.04 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  34.31 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  35.04 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  33.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  31.19 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  30.5 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  30.5 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  32.37 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  28.67 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  29.53 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  34.06 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  31.09 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  28.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  28.38 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.36 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  30.7 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  31.96 
 
 		 137 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>