34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2631 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  52.63 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  47.1 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  47.76 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  41.61 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  42.34 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  39.85 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  41.54 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  35.34 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  46.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  30.71 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  28.17 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  31.88 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  43.14 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  46 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  27.21 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  31.34 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  42.31 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  32.11 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  41.18 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30.7 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  40.82 
 
 		 188 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  29.82 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  36.05 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>