27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0266 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  47.48 
 
 
152 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  46.1 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  44.85 
 
 
142 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  39.85 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  39.23 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  34.81 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  34.33 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  40.5 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  40.5 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  32.59 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  33.82 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  26.76 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  34.17 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  32.88 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  26.32 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  26.92 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  31.58 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  44.44 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 
134 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  29.71 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  28.08 
 
 
140 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  29.05 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>