63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1139 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  38.24 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  32.37 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  37.61 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  35.66 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  34.81 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  35.82 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  31.94 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  34.06 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  29.08 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  29.08 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.78 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  33.8 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  32.85 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  31.11 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.84 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  34.43 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  32.12 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  30.56 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  30.56 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  30.34 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  32.5 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.33 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  32.5 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.82 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  30.88 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  30.5 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  29.5 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.27 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  29.2 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  26.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  30.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  27.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  31.29 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  21.9 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  31.51 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  31.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  31.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  30.07 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  29.71 
 
 		 140 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  29.05 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  30.71 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  30.5 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  30.5 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  31.01 
 
 		 137 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  28.68 
 
 		 142 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  29.66 
 
 		 131 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>