40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1057 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  88.97 
 
 		 136 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  68.35 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  68.35 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  64.03 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  65.47 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  40.6 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  35.9 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  36.75 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.85 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  29.79 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  34.75 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.9 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  36.09 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.33 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  27.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  27.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  33.93 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.17 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  28.1 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  27.97 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  31.25 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  25.23 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  31.93 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.68 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  30.6 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  25.23 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  25.23 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  23.64 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  26.13 
 
 		 136 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  26.55 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>