37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0730 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  100 
 
 
136 aa  268  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  100 
 
 
136 aa  268  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  34.29 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.08 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  23.7 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  29.71 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  28.46 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  28.38 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  35.4 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  29.37 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.66 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  33.57 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  27.86 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  30.99 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  32.85 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  33.81 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  30.08 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  30.22 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  29.63 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  27.86 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  29.5 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  30.15 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  30.91 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  31.93 
 
 
147 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  26.28 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  31.34 
 
 
136 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  27.78 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>