40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3766 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  47.01 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  34.81 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  35.11 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  35.97 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  37.96 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  33.81 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  34.35 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  34.35 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  36.03 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  32.33 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  34.62 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  34.88 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  31.45 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.76 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.29 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  30.94 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  32.74 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  25.87 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.35 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  29.5 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  25.78 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  28.7 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.99 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  30.89 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  39.22 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  29.82 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>