47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2942 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  71.94 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  69.78 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  68.35 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  67.63 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  36.57 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  35.71 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  33.09 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.11 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  33.08 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  35.07 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.93 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  33.82 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  30.22 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  34.01 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.72 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  28.32 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  28.1 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  33.63 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  31.86 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  30.37 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  28.83 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  24.37 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  25.74 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  32.64 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  25.66 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  30.82 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  27.43 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>