51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0727 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  48.48 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  42.76 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  47.29 
 
 
179 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  40.83 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  40.83 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  40.83 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  36.5 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  40.14 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  37.16 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  35.66 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  35.82 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  32.03 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  36.92 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  36.92 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  35.82 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  36.49 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  35.62 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  38.35 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  35.97 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.46 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  32.31 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  32.89 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  33.58 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  34.44 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  34.07 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  36.64 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  59.46 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  58.33 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  58.33 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  58.33 
 
 
210 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  58.33 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  58.33 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  58.33 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.42 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.8 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  29.51 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.8 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  29.31 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 
138 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  41.82 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>