62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2605 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  283  8e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  48.48 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  43.94 
 
 		 174 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  46.9 
 
 		 174 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  46.94 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  44.78 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  43.15 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  43.15 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  45.52 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  48.28 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  43.28 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  43.28 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  44.03 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  45.52 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  45.52 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  42.66 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  44.03 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  45.11 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  41.79 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  37.07 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  35.11 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  43.1 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  35.04 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  38.66 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  37.21 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  40.16 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  43.55 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  43.08 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  42.48 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  39.2 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  36.17 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  40.83 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  58.93 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  38.55 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.06 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  29.13 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  29.13 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  31.3 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  32.28 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  29.41 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  29.27 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  27.34 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  26.56 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  29.71 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>