34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0715 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  65.67 
 
 		 137 aa  186  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  35.2 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  32.54 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  35.25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  34.38 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  30.08 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  34.38 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  29.63 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  32.28 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  28.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  32.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  32 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  32.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  32.28 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  33.86 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  30.95 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  31.15 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  34.15 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  30.34 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  28.57 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>