37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1132 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  65.67 
 
 		 138 aa  186  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  42.37 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  35.34 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  35.61 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  32.03 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  31.85 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  28.03 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  31.03 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  29.75 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  30.89 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  32.46 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  28.93 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  28.35 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  29.03 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  29.27 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  31.75 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  30.16 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  27.27 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  30.58 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  30.58 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  31.71 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  27.64 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  29.91 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  29.91 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  23.01 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  24.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>