56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1374 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  100 
 
 		 165 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  87.88 
 
 		 165 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  78.52 
 
 		 171 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  72.96 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  74.03 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  75.68 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  70 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  70 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  74.03 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  74.03 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  53.74 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  52.47 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  52.38 
 
 		 174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  51.7 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  52.74 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  70.73 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  69.41 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  72.6 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  72.6 
 
 		 210 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  72.6 
 
 		 210 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  72.6 
 
 		 210 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  72.6 
 
 		 210 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  40.71 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  44.8 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  41.27 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  38.35 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.28 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  35.82 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  33.55 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  36.09 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  31.09 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  32.54 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  36.09 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  29.75 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.88 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.51 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  30.5 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.91 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  26.45 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  26.45 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.14 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.08 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  24.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.27 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  28.1 
 
 		 139 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.05 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>