57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0679 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  76.26 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  67.63 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  55.88 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  52.67 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  54.07 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  41.35 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  36.92 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  36.69 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  32.09 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  38.66 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  36.96 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  34.81 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  34.81 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.84 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.21 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  24.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  32.61 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  32.46 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  29.75 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  29.75 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  30.58 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  28.1 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  30.88 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  31.39 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  31.39 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  30.15 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  29.75 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  29.31 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  28.1 
 
 		 165 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  33.81 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  29.55 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.93 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  23.01 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  26.45 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  31.09 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  28.81 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25150  hypothetical protein  47.73 
 
 		 63 aa  40  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>