25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2866 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  45.77 
 
 
146 aa  140  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  46.58 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  40.14 
 
 
158 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  40.69 
 
 
144 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  37.16 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  42.06 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  31.65 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  34.35 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  32.41 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  36.18 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  32.67 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  31.39 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  34.72 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  37.18 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  31.43 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3253  hypothetical protein  28.06 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  40.62 
 
 
147 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4389  hypothetical protein  49.15 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.900665  hitchhiker  0.000000548399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.89 
 
 
145 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4487  hypothetical protein  52.94 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.208977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>