21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0214 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  48.54 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  51.49 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  46.6 
 
 
145 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  47.06 
 
 
158 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  46.6 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  48.54 
 
 
149 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  47.47 
 
 
144 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  38.83 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  39.81 
 
 
159 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  41.58 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  41.58 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  40.78 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  46.99 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  38.61 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  35.92 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4487  hypothetical protein  54.35 
 
 
48 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.208977  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3253  hypothetical protein  29.59 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  37.74 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>