20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0498 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  34.15 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  31.76 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  34.9 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  31.29 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  30.77 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  28.85 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  28.12 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  32.8 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  30.46 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  32.1 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  31.76 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  31.94 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3253  hypothetical protein  26 
 
 
149 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>