19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1702 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  36.18 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  35.37 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  32.64 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  32.03 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  30.99 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  33.85 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  33.85 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  37.74 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  33.8 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  32.1 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  48.94 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>