22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1690 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0880  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0942  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  87  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0578  hypothetical protein  36.11 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0837806  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  39.84 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0135  hypothetical protein  30.56 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.751747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3076  hypothetical protein  39.34 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0214  hypothetical protein  41.58 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0757  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0082661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4326  hypothetical protein  39.5 
 
 
144 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0498  hypothetical protein  33.11 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0111  hypothetical protein  36.76 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0343682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0349  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667953  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3071  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1702  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4388  hypothetical protein  34.62 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979546  hitchhiker  0.0000000471014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4487  hypothetical protein  40.43 
 
 
48 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.208977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  35.96 
 
 
148 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4389  hypothetical protein  54.29 
 
 
61 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.900665  hitchhiker  0.000000548399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>