22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2035 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  44.27 
 
 
147 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  36.55 
 
 
153 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  38.36 
 
 
147 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  36.03 
 
 
153 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  33.56 
 
 
155 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  35.66 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  34.81 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  32.59 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  36 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  34.09 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  29.84 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  50 
 
 
62 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  34.27 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  27.54 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3531  PilT protein-like  29.37 
 
 
162 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17101  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  26.4 
 
 
137 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  23.28 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  32.48 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2866  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.486103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>