16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1581 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  38.69 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  32.09 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  35.56 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  36.5 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  34.06 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  29.41 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  28.68 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  28.37 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30.94 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  28.8 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  29.84 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  35.06 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>