16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2205 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  34.93 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  40.74 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  32.23 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  32.56 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30.61 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  31.51 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  24.79 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  26.03 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  30.08 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>