20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0658 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  35.66 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  32.19 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  30.77 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  35.59 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  33.1 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  31.85 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  29.51 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  26.03 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  30.88 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  27.13 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  47.5 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  23.02 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  35.06 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  25.96 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>